PDFには様々な形式があり、スコアメーカーで開けない(認識するために読み込めない)ものが一部にあります。
そのような楽譜は、他社製ソフトでPDFを画像に変換してから認識してください。
詳しくはスコメスタイルの「PDF形式の楽譜を認識してSDXに」をご覧ください。
問題は解決しましたか?