スコアメーカーは、テキストとして埋め込まれたPDFファイルを正確に認識することが一つの特長ですが、PDFファイルには様々な形式のものがあり、場合によってテキストの文字コードを正しく認識できないことがあります。
このようなPDFの場合は、ページ登録ステップの「ページの選択」ダイアログボックスで「強制的に画像認識」を選択して画像認識することで、正しく認識できることがあるのでお試しください。
問題は解決しましたか?